Het eerste begin van de Clini Clowns gaat ver terug tot in de jaren zestig.

De Amerikaanse clown Patch Adams behandelde zijn patiënten al als clown.

Het idee kwam van Michael Cristensen als clown van het Big Apple Circus.

Als zijn broer in de jaren tachtig in het ziekenhuis komt te liggen kwam hij geregeld langs om hem op te vrolijken. Daar ziet hij hoe belangrijk het is om zieke mensen/kinderen op te vrolijken als ze in het ziekenhuis liggen. Als artsen hem vragen om op te treden in het Baby’s  & Children’s Hospital of Columbia Presbyterian Medical Centre Wil Cristensen dat graag doen. Het is een groot succes en ook het begin van clownsbezoeken in ziekenhuizen. Als uiteindelijk de broer van Michael Cristensen komt te overlijden erft Michael zijn dokterstas en is de clown Dr. Stubs geboren. In 1986 richt hij de Big Apple Clown Care Unit in New York op.  De positieve verhalen van Michael Cristensen bereiken al heel snel Europa.  Prinses Stephanie  zorgt er in 1991 dat in Oostenrijk de Rode Neuzen werden opgezet.

Voor de Nederlandse professor Tom Voute (hoofd afdeling kinderoncologie van het Emma Kinderziekenhuis en het kinder AMC) Was dit het teken om Clini Clowns Nederland op te richten. Op 17 november 1992 werd Stichting Clini Clowns Nederland opgericht.

In 1993 speelden de eerste twee Clini Clowns in het Emma Kinderziekenhuis In Amsterdam. Inmiddels hebben ze 76 Clini Clowns die professioneel opgeleid zijn op als Clown in het ziekenhuis kinderen op te vrolijken. Zij Vrolijken zieke kinderen op om even hun ziekte te vergeten.

Niet alleen in het ziekenhuis zijn Clini Clowns maar Clini Clowns komen bijvoorbeeld ook op scholen en bij kinderen met een handicap. Ook komen Clini Clowns bij de zieke kinderen en de ouders thuis.